国家级经济技术开发区投资环境综合评价，是由国家商务部组织的，每年一次对全国54个国家级经济技术开发区进行的，内容涵盖综合经济实力、基础设施配套能力、经营成本、人力资源及社会成本、环境保护及节能排、技术创新环境、管理体制建设、发展与效益等八大类共计97项指标的综合考核评比。此项评比，前两年南京经济技术开发区都是第11位，07年取代了上海金桥，跻身国家级开发区前十名行列，其中管理体制建设指标并列第1，发展与效益指标位列第4，技术创新环境指标位列第9。